Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA3O96018 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA3O96018 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA3O96018 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA3O96018 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA3O96018 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA3O96018 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA3O96018 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APBA3O96018 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APBA3O96018 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA3O96018 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA3O96018 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA3O96018 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA3O96018 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA3O96018 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA3O96018 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA3O96018 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA3O96018 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms