Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTLL1O95922 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms