Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR1AO95602 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms