Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24BO95487 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms