Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIOO75962 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIOO75962 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIOO75962 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIOO75962 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIOO75962 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIOO75962 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIOO75962 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIOO75962 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms