Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLOT1O75955 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms