Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALMO75781 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALMO75781 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALMO75781 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALMO75781 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALMO75781 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALMO75781 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALMO75781 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALMO75781 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALMO75781 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALMO75781 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALMO75781 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALMO75781 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALMO75781 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALMO75781 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALMO75781 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PALMO75781 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALMO75781 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALMO75781 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALMO75781 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALMO75781 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms