Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 LARP7-215ENST00000513553 528 ntTSL 32.56□□□□□ -26e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.044e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.843e-6■■■■■ 160.8
SF3B1O75533 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 IQCB1-203ENST00000393650 2253 ntTSL 515.61■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-9■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 IQCB1-204ENST00000460108 988 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-9■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 IQCB1-207ENST00000498104 701 ntTSL 310.72□□□□□ -0.691e-9■■■■■ 160.7
SF3B1O75533 H2AFY-211ENST00000507868 861 ntTSL 226.14■■□□□ 1.773e-6■■■■■ 160.6
SF3B1O75533 TMCO6-212ENST00000514449 760 ntTSL 527.37■■□□□ 1.971e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ENTPD6-205ENST00000417467 809 ntTSL 526.78■■□□□ 1.881e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ENTPD6-210ENST00000433417 940 ntTSL 226.78■■□□□ 1.881e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SBF2-AS1-205ENST00000527406 666 ntTSL 426.65■■□□□ 1.861e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.811e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LSM7-205ENST00000589532 539 ntTSL 326.22■■□□□ 1.791e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ENTPD6-212ENST00000439162 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 326.1■■□□□ 1.771e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.751e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.721e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PQLC3-205ENST00000445402 565 ntTSL 425.44■■□□□ 1.661e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RGL2-237ENST00000425946 640 ntTSL 325.41■■□□□ 1.661e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.641e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.611e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.591e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LSM7-206ENST00000591515 710 ntTSL 224.94■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMCO6-205ENST00000505086 811 ntTSL 224.41■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PANK4-207ENST00000491212 725 ntTSL 324.31■■□□□ 1.481e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TH2LCRR-204ENST00000458509 407 ntTSL 1 (best)24.24■■□□□ 1.471e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.451e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMCO6-206ENST00000509217 540 ntTSL 423.74■■□□□ 1.391e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZSCAN5A-216ENST00000592679 923 ntTSL 223.55■■□□□ 1.361e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMCO6-202ENST00000394669 375 ntTSL 223.53■■□□□ 1.361e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PQLC3-207ENST00000464700 453 ntTSL 223.1■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PRKAR2A-203ENST00000419216 581 ntTSL 423.07■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.241e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.231e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CYB5R1-204ENST00000478009 899 ntTSL 222.66■■□□□ 1.221e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ADGRV1-229ENST00000640281 1466 ntTSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.191e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.181e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.121e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 HEXDC-208ENST00000580235 638 ntTSL 322.01■■□□□ 1.111e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 321.81■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMCO6-210ENST00000511410 994 ntTSL 221.56■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RPS6KB1-208ENST00000489824 909 ntTSL 321.52■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TNK2-215ENST00000468680 737 ntTSL 221.34■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PQLC3-208ENST00000476787 469 ntTSL 321.29■■□□□ 11e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 BX322557.1-201ENST00000454115 389 ntTSL 1 (best)21.27■□□□□ 0.991e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ENTPD6-207ENST00000425813 945 ntTSL 521.24■□□□□ 0.991e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SMYD2-203ENST00000460580 1618 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RPS6KB1-207ENST00000477179 431 ntTSL 321.03■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 IREB2-209ENST00000560454 545 ntTSL 520.94■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-211ENST00000560995 621 ntTSL 420.93■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PAK4-210ENST00000599657 534 ntTSL 420.9■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TNK2-218ENST00000478715 1048 ntTSL 220.85■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.911e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZNF598-205ENST00000564556 889 ntTSL 320.69■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MAP1LC3B-203ENST00000562778 560 ntTSL 420.67■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DMPK-209ENST00000596067 498 ntTSL 520.65■□□□□ 0.97e-11■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 420.54■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ADGRV1-210ENST00000638316 2221 ntTSL 520.47■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CAND2-202ENST00000446928 771 ntTSL 320.41■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMEM64-206ENST00000521852 587 ntTSL 420.38■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-215ENST00000561416 507 ntTSL 420.32■□□□□ 0.841e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ENTPD6-211ENST00000435520 878 ntTSL 320.13■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-216ENST00000563584 505 ntTSL 520.09■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-209ENST00000560786 547 ntTSL 420.09■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-205ENST00000558689 649 ntTSL 520.02■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMCO6-204ENST00000504069 543 ntTSL 519.94■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PPAN-205ENST00000446223 844 ntTSL 319.81■□□□□ 0.761e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ENTPD6-206ENST00000418890 656 ntTSL 319.8■□□□□ 0.761e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-218ENST00000567189 550 ntTSL 419.56■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 NXF1-206ENST00000527902 619 ntTSL 319.26■□□□□ 0.671e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIAA0895L-211ENST00000568563 1977 ntTSL 519.23■□□□□ 0.671e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.671e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 JMJD6-204ENST00000542934 1898 ntTSL 219.13■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ETV6-203ENST00000541426 572 ntTSL 419.09■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MAP1LC3B-202ENST00000561823 456 ntTSL 219.03■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AL365277.1-207ENST00000440190 681 ntTSL 319■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 160.4
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1554.8 ms