Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F6O75461 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F6O75461 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F6O75461 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F6O75461 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F6O75461 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F6O75461 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F6O75461 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F6O75461 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms