Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX3O75364 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX3O75364 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITX3O75364 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms