Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIA4O75335 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms