Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms