Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG13O75143 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG13O75143 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG13O75143 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms