Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms