Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREM1O60565 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREM1O60565 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREM1O60565 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREM1O60565 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREM1O60565 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREM1O60565 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREM1O60565 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GREM1O60565 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREM1O60565 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREM1O60565 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GREM1O60565 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GREM1O60565 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GREM1O60565 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREM1O60565 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREM1O60565 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GREM1O60565 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GREM1O60565 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms