Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SORBS3O60504 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORBS3O60504 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORBS3O60504 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms