Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms