Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDE6DO43924 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PDE6DO43924 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE6DO43924 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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