Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NDUFS5O43920 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDUFS5O43920 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms