Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCRTO43612 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCRTO43612 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCRTO43612 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCRTO43612 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCRTO43612 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCRTO43612 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCRTO43612 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCRTO43612 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCRTO43612 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCRTO43612 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCRTO43612 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCRTO43612 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCRTO43612 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCRTO43612 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCRTO43612 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCRTO43612 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCRTO43612 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCRTO43612 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCRTO43612 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCRTO43612 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCRTO43612 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms