Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L2O43491 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB41L2O43491 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms