Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COCHO43405 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COCHO43405 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COCHO43405 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COCHO43405 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COCHO43405 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COCHO43405 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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