Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms