Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRRTM2O43300 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms