Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms