Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRXO43186 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRXO43186 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRXO43186 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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