Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEFVO15553 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEFVO15553 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEFVO15553 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEFVO15553 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEFVO15553 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEFVO15553 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms