Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAPBPO15533 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAPBPO15533 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms