Protein–RNA interactions for Protein: O15247

CLIC2, Chloride intracellular channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC2O15247 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC2O15247 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms