Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms