Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A2O14975 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms