Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3AO14802 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3AO14802 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms