Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APAF1O14727 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APAF1O14727 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APAF1O14727 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APAF1O14727 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APAF1O14727 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APAF1O14727 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms