Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCANO14594 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCANO14594 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCANO14594 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCANO14594 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCANO14594 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCANO14594 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCANO14594 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCANO14594 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCANO14594 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCANO14594 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCANO14594 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCANO14594 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCANO14594 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCANO14594 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms