Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARVCFO00192 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms