Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CCER2I3L3R5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms