Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
I3L3M4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
I3L3M4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
I3L3M4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
I3L3M4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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