Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H7C417 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H7C417 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
H7C417 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
H7C417 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C417 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C417 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C417 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C417 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms