Protein–RNA interactions for Protein: H0YCG3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YCG3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H0YCG3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H0YCG3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H0YCG3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H0YCG3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H0YCG3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H0YCG3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
H0YCG3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H0YCG3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H0YCG3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H0YCG3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H0YCG3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H0YCG3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H0YCG3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H0YCG3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms