Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms