Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms