Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E1Z4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E1Z4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4E1Z4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4E1Z4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4E1Z4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B4E1Z4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms