Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms