Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85CA6NKD9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms