Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM30A4D0T7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM30A4D0T7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM30A4D0T7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms