Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC144AA2RUR9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC144AA2RUR9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC144AA2RUR9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC144AA2RUR9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC144AA2RUR9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC144AA2RUR9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms