Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 PNPT1P1-201ENST00000450418 2315 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RTTN-202ENST00000578780 2333 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 WNT3-201ENST00000225512 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TROVE2-202ENST00000367443 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC01310-201ENST00000380981 4015 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OARD1-210ENST00000479950 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ITIH4-212ENST00000485816 2990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC097534.2-203ENST00000609900 1921 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CDCA7-201ENST00000306721 2789 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SEC14L3-201ENST00000215812 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC015883.1-201ENST00000623054 2074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MTBP-201ENST00000305949 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SAMD8-204ENST00000542569 6782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TIGIT-203ENST00000481065 3710 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZSCAN30-205ENST00000589178 3368 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TTLL6-205ENST00000433608 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OR2A20P-204ENST00000641121 2173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TMTC4-202ENST00000342624 3602 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ADH4-201ENST00000265512 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TUFT1-203ENST00000368849 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AP3B2-209ENST00000542200 3921 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GNPDA1-201ENST00000311337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TRIM16-201ENST00000336708 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MMP2-208ENST00000570308 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DOCK8-202ENST00000382331 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ACYP1-202ENST00000357971 650 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 VSTM1-203ENST00000376626 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC007207.1-202ENST00000393388 498 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AP000692.1-201ENST00000397184 596 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FAM192BP-201ENST00000414628 762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL359738.1-201ENST00000419667 430 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GOT2P3-201ENST00000426641 1289 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC098828.3-201ENST00000430429 746 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL136529.1-201ENST00000430540 610 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 KCNMB2-AS1-204ENST00000437488 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC098820.1-202ENST00000438978 750 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RPSAP27-201ENST00000442177 850 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL596087.2-201ENST00000451784 484 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TDRG1-204ENST00000451810 919 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ID2-AS1-207ENST00000455965 794 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 IGHV3-33-2-201ENST00000517703 346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MOK-223ENST00000522534 796 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC090099.3-201ENST00000524640 979 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AP002512.1-201ENST00000525853 653 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AP003392.1-201ENST00000531087 523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC025161.1-201ENST00000552481 591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ACYP1-203ENST00000553302 606 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FOXC2-AS1-201ENST00000563280 319 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HMGN2P40-201ENST00000566875 391 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL744P-201ENST00000577604 267 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL712P-201ENST00000579354 308 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL262P-201ENST00000584590 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 BRCA1-227ENST00000591849 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC005176.1-202ENST00000597791 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PCBP1-AS1-320ENST00000627918 1146 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 EGFLAM-203ENST00000354891 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 UPRT-202ENST00000373379 2234 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TAF1A-202ENST00000352967 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TOX4P1-201ENST00000514955 1862 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL122035.2-201ENST00000609125 1870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HIP1-207ENST00000616821 3120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 IFT172-201ENST00000260570 5415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MCOLN3-203ENST00000370589 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TMEM255A-201ENST00000309720 3394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 BHLHB9-201ENST00000361229 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LRRC52-201ENST00000294818 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PKD2L2-206ENST00000508883 2282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MRPL27-202ENST00000442592 2441 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZEB2-229ENST00000629520 2564 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC100788.2-201ENST00000625199 2889 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC00346-201ENST00000538077 6265 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MYH16-203ENST00000439784 5836 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 IQSEC2-201ENST00000375365 4004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 C1S-201ENST00000328916 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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