Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AC137936.1-201ENST00000636316 845 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 LINC00694-203ENST00000636468 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC027369.1-201ENST00000640698 1105 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 IL6-204ENST00000404625 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 ZNF433-201ENST00000344980 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AL513534.1-201ENST00000562082 2295 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 RPE-206ENST00000429921 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 BROX-208ENST00000539697 3734 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 STOML3-202ENST00000423210 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 EPC1-202ENST00000319778 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 MARK2P11-201ENST00000518523 1670 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC021945.1-201ENST00000623964 1650 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 ZNF582-AS1-202ENST00000587979 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LCP1P13796 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 PRR23D2-201ENST00000528972 1587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 PRR23D1-201ENST00000533250 1587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AP001180.1-201ENST00000562202 3566 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 EPSTI1-201ENST00000313624 3114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 DACH2-206ENST00000508860 1775 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 RN7SKP134-201ENST00000363960 269 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AL355864.1-201ENST00000401937 526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC007179.2-205ENST00000412409 707 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AL445070.1-201ENST00000414631 714 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AL831784.1-201ENST00000427302 373 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 TGFA-IT1-201ENST00000441238 436 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC006970.1-201ENST00000442064 389 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 RUSC1-AS1-201ENST00000443642 679 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC069285.1-201ENST00000450891 419 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 HIST1H2APS5-201ENST00000454320 369 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC092850.1-201ENST00000464655 1109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 MRPL27-203ENST00000503633 742 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 VN1R46P-201ENST00000519939 850 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC245187.1-201ENST00000520162 559 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 IGLV3-31-201ENST00000523713 297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 SLN-203ENST00000531293 906 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC021818.1-201ENST00000561316 547 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 BEAN1-AS1-203ENST00000569125 530 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 LINC01982-201ENST00000572848 308 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 FAAP24-205ENST00000590281 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 LINC01255-205ENST00000591318 708 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 NAPGP1-201ENST00000603818 719 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 NDUFB1-206ENST00000605997 336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AL359921.2-201ENST00000608547 543 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 AC092135.2-201ENST00000624702 506 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 OR52R1-201ENST00000624978 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 FOXCUT-201ENST00000628509 333 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 STRADA-241ENST00000639835 2130 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 RAD52-202ENST00000358495 2710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 GP2-203ENST00000381360 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LCP1P13796 PRAMEF4-201ENST00000235349 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LCP1P13796 TMBIM4-209ENST00000544599 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LCP1P13796 MYT1L-203ENST00000407844 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LCP1P13796 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LCP1P13796 SMIM7-221ENST00000627144 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LCP1P13796 AC022336.3-201ENST00000624807 1986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LCP1P13796 CHEK2-207ENST00000403642 1359 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LCP1P13796 AC098934.2-201ENST00000456105 2321 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 C9orf43-201ENST00000288462 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 GRHL3-204ENST00000361548 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 C22orf23-203ENST00000403305 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 TRPV3-201ENST00000301365 3235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 PART1-201ENST00000504876 5616 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 SIRPB1-201ENST00000262929 1659 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 ASB9-203ENST00000380488 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 HTR3B-202ENST00000537778 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 RPL23-201ENST00000245857 588 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 OR6T1-201ENST00000321252 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 RN7SKP54-201ENST00000410704 269 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 AL360268.2-201ENST00000414976 380 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 PLA2G6-204ENST00000417303 501 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 LDAH-206ENST00000419825 826 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 HCG23-205ENST00000426643 610 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 RPSAP23-201ENST00000446095 883 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 AC011452.1-201ENST00000451973 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 AC108448.1-201ENST00000455154 293 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 GUSBP2-203ENST00000492832 801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 CTNNA2-214ENST00000496558 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 AL662844.2-201ENST00000538455 284 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 AC092115.2-201ENST00000562696 575 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LCP1P13796 RN7SL744P-201ENST00000577604 267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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