Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms