Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms